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CodonCode Aligner Sequence Assembler 3.7.1

Développeur - Mac OS, Windows - Fichier d'installation Aligner_Installer.exe (34.18 MB) - Commercial
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MD5: 47942a9d42450ff0a04625ea946182ac

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Description de développeur

"User-friendly sequence assembly and alignment"

CodonCode Aligner est un logiciel convivial pour l’assemblage, l’alignement, l’édition de contig et la détection de mutations de séquences d’ADN. Outre les fonctionnalités courantes dans les programmes d'assemblage de séquences, telles que le clipping d'extrémité, les alignements sur les séquences de référence, l'alignement d'ADNc sur l'ADN génomique et l'exportation, CodonCode Aligner offre de nombreuses fonctionnalités uniques, absentes des autres logiciels.
                              
            Les fonctionnalités avancées de CodonCode Aligner incluent:
            - Assembler par nom: créez des centaines de contigs en quelques secondes, à partir de noms d'échantillons
            - Des séquences de consensus précises basées sur les qualités de séquence éliminent le besoin de corriger des divergences triviales
            - Contigs of contigs: alignez les contigs les uns avec les autres avec ClustalW et revenez aux traces sous-jacentes par un simple double-clic
            - Automatiser avec un traitement en une étape et des scripts
            - Analyse de mutation sensible avec des outils uniques pour analyser les insertions et les délétions hétérozygotes
            - Utilisez des outils de pointe tels que Clustal, MUSCLE, Phred & Phrap dans CodonCode Aligner
            - Regardez mieux vos séquences ABI avec l’affinage des traces de CodonCode Aligner
            - Regardez les différences avec la table des différences et zoomez sur les contigs
            - Construisez des arbres de jonction de voisins pour trier vos échantillons par différences
                        
            CodonCode Aligner est facile à apprendre et à utiliser, mais puissant et hautement personnalisable. Il comprend une aide contextuelle détaillée avec des instructions "Comment faire" et des explications sur les algorithmes utilisés. CodonCode Aligner est largement utilisé dans les domaines suivants: phylogénétique, recherche sur l'évolution, biogéographie, détection de mutations et autres domaines de la recherche biomédicale.
                  
            Le téléchargement est une version d'évaluation entièrement fonctionnelle pendant 30 jours. Il peut être converti en version complète en achetant une licence. Les licences de CodonCode Aligner sont nettement moins chères que celles de progiciels comparables. Les licences "flottantes" sont disponibles sans frais supplémentaires et peuvent être partagées entre Windows et Mac OS X.

Exigences: Windows 2000 or newer, Mac OS X 10.4 or newer

Quoi de neuf dans cette version: New: Neighbor-Joining trees Zooming in alignments & assemblies Automatic reference sequence shortening after alignments Mask low coverage regions New and flexible consensus methods Set base numbers Automatic name scheme definitions for "Assemble & Align by Name" Customize toolbars directly through popup menus Rebuild the consensus See http://www.codoncode.com/aligner/new.htm

Info Antivirus

Download3K a téléchargé et testé CodonCode Aligner Sequence Assembler le 22 May 2012 sur uns des meilleurs moteurs antivirus actuellement disponibles. Vous trouverez ci-dessous les résultats de l’analyse:

  • Avira:

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  • Kaspersky:

    Propre

  • NOD32:

    Propre
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